12 Monkeys Season 1 giới thiệu câu chuyện về Cole (Aaron Stanford), một người đàn ông từ tương lai được gửi trở về quá khứ để ngăn chặn sự lây lan của một virus tàn phá sẽ gây ra một cuộc đại dịch toàn cầu vào năm 2043. Mùa đầu tiên gồm 13 tập phim, mở đầu với nhiệm vụ của Cole khi anh phải đối mặt với tổ chức bí ẩn "The Army of the 12 Monkeys," những người dường như có liên quan đến sự kiện này.
Câu chuyện trong mùa 1 tập trung vào việc Cole và Cassandra Railly (Amanda Schull) hợp tác để điều tra và ngăn chặn các âm mưu của "The Army of the 12 Monkeys," đồng thời giải quyết các vấn đề về du hành thời gian và những thay đổi trong dòng thời gian. Mùa này cũng khám phá các mối quan hệ cá nhân và những tình huống căng thẳng mà Cole phải đối mặt khi cố gắng hoàn thành nhiệm vụ của mình.
12 Monkeys Season 1 nổi bật với sự kết hợp giữa yếu tố khoa học viễn tưởng, hành động kịch tính và drama tâm lý, cung cấp cái nhìn sâu sắc về cuộc chiến chống lại thảm họa toàn cầu và các bí ẩn liên quan đến du hành thời gian.